Возможно те побеги, которые слабые получились, из замещающей почки пошли. У них изначально энергия роста ниже.
Возможно другая причина, заметил, что некоторым сортам длинная обрезка на кордоне противопоказана. У таких сортов слишком ярко выраженная полярность, которая сказывается не только на силе побегов в рамках одной плодовой стрелки, но и на силе роста побегов в рамках целого плеча кордона. Во как загнул... самому бы разобраться
То есть например, имеем кордон два плеча, на каждом плече по три рукава с плодовыми лозами и побегами. Крайние рукава растут прекрасно, все побеги на них сильные, следующие два рукава, которые ближе к центру куста, растут уже послабее, и ещё два рукава, которые самые близкие к центру куста имеют самые слабые побеги. Таким сортам кордон не подходит в принципе. Точнее подходит, но только при короткой обрезке на сучки. Если же сорту нужна длинная обрезка, то только веер. Иначе с полярностью не справиться.