Алексей , если это всё на одном рукаве, то видя толстый срез на втором фото, у меня пока одно предположение: возможно, что это усыхание спровоцировано обрезкой не на пенёк, а на кольцо. Потому что у винограда нет заращивания срезов каллюсом, но есть усыхание внутрь, вниз от среза. И чем меньше оставлен пенёк, тем глубже пойдёт усыхание.
А если это на разных рукавах и кустах, то скорее всего надо смотреть и проверять целостность самих рукавов.
Могут быть и другие причины, которые мне пока неведомы.
Могу, конечно, ошибаться, здесь у ребят опыта побольше, так что поправят.